新潟県
| 糸魚川市姫川河床 | ヒスイ、硫化メノウ、ジャスパー、ネフライト、紋石 |
| 糸魚川港から富山県へかけての海岸 | ヒスイ |
| 糸魚川市小滝を流れる姫川の支流小滝川全域（明星山の下に天然記念物指定地あり） | ヒスイ |
| 小滝川上流の土倉沢 | 化石（海百合） |
| 小滝川上流の東保沢 | ピンク色ネフライト（石灰質） |
| 糸魚川市小滝の姫川上流の東岸を流れる横川 | ヒスイ、蛋白石、硫化メノウ |
| 糸魚川市河口上流の右岸を流れる虫川 | メノウ |
| 小滝村の姫川上流の白馬温泉の右岸を流れる大所川上流及び山中 | ヒスイ、ネフライト |
| 西頸城郡青海町の青海川（上流の橋立地区の河床には天然記念物の指定地あり） | ヒスイ、ネフライト |
| 西頸城郡青海川上流の橋立地区上流の右岸金山谷合流点 | ヒスイ、ネフライト |
| 両津市（佐渡島）の新潟寄り前浜海岸の赤玉の中川上流 | ジャスパー |
| 佐渡郡畑野町猿八を流れる猿八川及びその周辺 | メノウ、ジャスパー（赤、青、黒色） |
| 佐渡郡外海府相川町岩谷口 | メノウ、五色メノウ |
| 佐渡郡羽茂町 | メノウ |
| 東蒲原郡津川町阿賀野川本流及び支流 | ジャスパー、紋石（牡丹石） |
| 東蒲原郡三川村 五十島鉱山 | ホタル石 |
| 東蒲原三川村綱木、古館 | メノウ、カルセドニー |
